目斗屿位在澎湖群岛的最北边，与其南侧的吉贝岛相隔七公里，全岛周长843公尺，面积仅0.0244平方公里，是一个迷你小岛，岛上以目斗屿灯塔闻名。由於目斗屿附近到吉贝屿之间均属深水海蚀台，水中暗礁处处，水深不及一公尺处比比皆是，也因为如此，海底的动植物均能受到充足的阳光，水面上的人也可以透视海底， 遨游美丽的海底世界。为了确保船只的安全，1899年在目斗屿上建灯塔。高约40公尺的铣铁灯塔，塔身为白色及蓝黑相间， 耸然矗立，为东亚最高之铣铁灯塔。

由玄武岩组成的目斗屿，极具原始风貌，黑色的岩石扎实地凝聚在岛的四周，激起浪花朵朵，透出一份豪壮之气。目斗屿和吉贝之间有一浅沙带，长数百公尺，宽约五公尺，海水仅及膝盖，人行其上好像在海面上行走，十分有趣。从吉贝前往目斗屿的航程上，由於水域较浅，充足的阳光让此海域拥有多样化的海洋生物，当阳光洒落下来，光芒轻快地跳跃在清澈碧绿的水面上，海底世界一览无遗。

目斗屿灯塔前方的港湾，为一处浮潜的圣地，任何一个初学者都可以在这里拥抱色彩绚丽附有生命力的海洋。目斗屿另一处特殊的景观─海底隧道。位在峭壁底端，涨潮时隐没在海中，退潮时则可容人侧身进入。隧道长约80m，为特殊微辉长斑岩裂隙，内有美丽的鱼类洄游，是潜水与探险好去处。